Un prêtre, religieux capucin, qui porte des stigmates, sonde ceux qui viennent se confesser jusqu’au fond du coeur ou encore apparaît en plusieurs endroits. Bientôt, des foules immenses de pèlerins se pressent vers lui. Tour à tour, les papes se montrent enthousiastes ou prudents, à l’image de beaucoup : car, si l’Eglise l’a canonisé en 2002, Padre Pio n’a jamais laissé personne indifférent.
Mais qui était-il ? Que peut-on dire des faits extraordinaires qui lui sont attribués ? Comment ont réagi les autorités de l’Eglise et pourquoi ? Que disent aujourd’hui ceux qu’il a marqués ?… Ce documentaire autour de Padre Pio est aussi une page d’histoire du catholicisme au XXe siècle, marquée par des bouleversements considérables.